Recommandations

Encéphalites infectieuses

Recommandation 2017 - version actualisée le 24/03/2026

Stratégie et outils diagnostics

Tout symptôme ou signe de dysfonctionnement du SNC associé à la fièvre doit faire évoquer une encéphalite.

La fièvre doit être recherchée dans les jours précédents par l’interrogatoire du patient ou des proches.

  • Sanguine
    • Deux paires d’hémocultures avant toute antibiothérapie
    • Numération avec formule sanguine avec plaquettes, ionogramme sanguin, glycémie (concomitante de la PL), CRP, ASAT, ALAT, bilirubine, phosphatases alcalines, bilan d’hémostase et CPK
    • Sérologie VIH indispensable. En cas de suspicion de primo-infection VIH, PCR ARN VIH (charge virale) 
  • LCS :
    • Ponction lombaire contre-indiquée avant l’imagerie (à faire en urgence) si :
      • Troubles de la vigilance
      • Signes de localisation déficitaires
      • Crises épileptiques focales ou généralisées
    • LCS au moins 120 gouttes (environ 50 microL/goutte)
      • 20 gouttes pour biochimie
      • 80 à 100 gouttes pour cytologie, microbiologie et virologie
      • Conserver une partie du LCS (si possible – 80°C) pour compléments d’investigations (dont le diagnostic de tuberculose)
    • En urgence : cytologie, protéinorachie, glycorachie, lactates et microbiologie.
    • Glycorachie impérativement associée à une glycémie concomitante, veineuse ou à défaut capillaire par dextro.
    • Examen bactériologique standard
    • PCR HSV, VZV et entérovirus impératives
    • PCR multiplex non recommandée en première intention
    • Recherche de BK si négativité des PCR précédentes ou très forte suspicion clinique ou épidémiologique

  • IRM cérébrale en urgence en première intention :
    • Avec séquences FLAIR
    • Diffusion, T2*, T1 sans et avec gadolinium
    • Séquences vasculaires veineuses et artérielles
  • Seulement si IRM impossible :
    • Tomodensitométrie cérébrale (TDM) sans et avec injection

Antibiothérapie probabiliste

Aciclovir (10mg/kg IV toutes les 8h)
+Amoxicilline (200mg/kg/j IV perfusion continue après dose de charge de 2g  ou en 4-6 administrations (perfusions de 30-60mn) espacées de 4-6h)

GRAVE
Réaction cutanée ou muqueuse ou cutanéomuqueuse  AIGUE  (survenant quelques minutes à quelques heures après l’exposition) ET un des symptômes suivant parmi :

  • A.Signes de défaillance respiratoire : dyspnée, bronchospasme, stridor, frein expiratoire, hypoxémie…
  • B. Signes de défaillance hémodynamique avec hypotension ou défaillance d’organe (syncope, hypotonie…)
  • C. Signes gastro-intestinaux : douleurs abdominales aigues, vomissements

Hypotension ou bronchospasme ou œdème laryngé aigue après une exposition (quelques minutes à quelques heures après l’exposition), même en absence de réaction cutanée ou muqueuse typique

Effets secondaires cutanés sévères parmi :

  • A.Syndrome de Stevenson Johnson ou épidermolyse nécrosante suraiguë de Lyell : Apparition de vésicules ou croûtes, de couleur gris-violacé, douloureuses  ou aspect de brûlures de la peau et/ou des muqueuses avec fièvre et sensation de malaises, apparition de  lésions érosives hémorragiques des muqueuses, apparition d’un décollement de la peau
  • B.PEAG (pustulose-exanthématique aiguë généralisée)
  • C.Purpura (vascularite)
  • D.DRESS syndrome : Exanthème maculo-papuleux  avec atteinte  > 50% de la surface corporelle, avec défaillance d’organe, hyperéosinophilie, cytolyse hépatique, insuffisance rénale aigue
  • E.Œdème de la face, éruption œdémateuse et infiltration cutanée de la peau. Fièvre ≥ 38.5°. (PEAG, DRESS syndrome)

NON GRAVE
Un critère parmi :

  • A. Réaction cutanée : urticaire, érythème, prurit, picotements, démangeaisons des lèvres
  • B. Atteinte de l’arbre respiratoire supérieur  : rhinorrhée, congestion nasale, prurit nasal, éternuements, démangeaison dans la gorge, toux sans bronchospasme.
  • C. Atteinte des conjonctives : érythème, prurit..

Exanthème maculo-papuleux sans défaillance d’organe

Autres : nausées, goût métallique dans la bouche

Sulfamethoxazole-trimethoprime (1,6g+320mg) /8-12h p.o. (si grossesse : déconseillé avant 10 semaines d’aménorrhée)
OU (50+10mg)/kg/j IV en 3 administrations espacées de 8h (si grossesse : déconseillé avant 10 semaines d’aménorrhée)

Vérifier la compatibilité de la recommandation avec la situation du malade

Sulfamethoxazole-trimethoprime (1,6g+320mg) /8-12h p.o. (si grossesse : déconseillé avant 10 semaines d’aménorrhée)
OU (50+10mg)/kg/j IV en 3 administrations espacées de 8h (si grossesse : déconseillé avant 10 semaines d’aménorrhée)

Vérifier la compatibilité de la recommandation avec la situation du malade

  • Réévaluation systématique à 48h.

  • Vésicules cutanées ou signes de vasculopathie à l’imagerie :
    • Aciclovir (10mg/kg IV toutes les 8h)
  • LCS trouble :
    • Appliquer les recommandations sur la prise en charge des méningites bactériennes communautaires
  • Examen microscopique du LCS positif :
    • Débuter un traitement étiologique.
  • Traitement anti tuberculeux (en plus du traitement par Aciclovir + Amoxicilline) seulement si :
    • Présence d’éléments fortement évocateurs : terrain, anamnèse, caractéristiques du LCS, localisations extra neurologiques, imagerie
    • OU Présence de BAAR ou PCR temps réel positive

  • Corticothérapie associée en cas d’encéphalite à HSV :
    • Intérêt non démontré à ce jour
  • Traitement anti-convulsivant en l’absence de crise convulsive :
    • Non recommandé

  • PCR HSV positive :
    • Arrêt  Amoxicilline
    • Et maintien Aciclovir (10mg/kg/8h) 14j (21j si immunodépression)
  • PCR VZV positive :
    • Aciclovir (10mg/kg/8h) pendant 21j
  • PCR entérovirus positive :
    • Arrêt Aciclovir et Amoxicilline.
  • Listeria :
    • Arrêt Aciclovir
    • Amoxicilline (200mg/kg/j IV perfusion continue après dose de charge de 2g  ou en 4-6 administrations (perfusions de 30-60mn) espacées de 4-6h, pendant 21j)
      + Gentamicine (5mg/kg en une dose unique quotidienne pendant 5j)

GRAVE
Réaction cutanée ou muqueuse ou cutanéomuqueuse  AIGUE  (survenant quelques minutes à quelques heures après l’exposition) ET un des symptômes suivant parmi :

  • A.Signes de défaillance respiratoire : dyspnée, bronchospasme, stridor, frein expiratoire, hypoxémie…
  • B. Signes de défaillance hémodynamique avec hypotension ou défaillance d’organe (syncope, hypotonie…)
  • C. Signes gastro-intestinaux : douleurs abdominales aigues, vomissements

Hypotension ou bronchospasme ou œdème laryngé aigue après une exposition (quelques minutes à quelques heures après l’exposition), même en absence de réaction cutanée ou muqueuse typique

Effets secondaires cutanés sévères parmi :

  • A.Syndrome de Stevenson Johnson ou épidermolyse nécrosante suraiguë de Lyell : Apparition de vésicules ou croûtes, de couleur gris-violacé, douloureuses  ou aspect de brûlures de la peau et/ou des muqueuses avec fièvre et sensation de malaises, apparition de  lésions érosives hémorragiques des muqueuses, apparition d’un décollement de la peau
  • B.PEAG (pustulose-exanthématique aiguë généralisée)
  • C.Purpura (vascularite)
  • D.DRESS syndrome : Exanthème maculo-papuleux  avec atteinte  > 50% de la surface corporelle, avec défaillance d’organe, hyperéosinophilie, cytolyse hépatique, insuffisance rénale aigue
  • E.Œdème de la face, éruption œdémateuse et infiltration cutanée de la peau. Fièvre ≥ 38.5°. (PEAG, DRESS syndrome)

NON GRAVE
Un critère parmi :

  • A. Réaction cutanée : urticaire, érythème, prurit, picotements, démangeaisons des lèvres
  • B. Atteinte de l’arbre respiratoire supérieur  : rhinorrhée, congestion nasale, prurit nasal, éternuements, démangeaison dans la gorge, toux sans bronchospasme.
  • C. Atteinte des conjonctives : érythème, prurit..

Exanthème maculo-papuleux sans défaillance d’organe

Autres : nausées, goût métallique dans la bouche

Sulfamethoxazole-trimethoprime (1,6g+320mg) /8-12h p.o. (si grossesse : déconseillé avant 10 semaines d’aménorrhée)
OU (50+10mg)/kg/j IV en 3 administrations espacées de 8h (si grossesse : déconseillé avant 10 semaines d’aménorrhée)

Vérifier la compatibilité de la recommandation avec la situation du malade

Sulfamethoxazole-trimethoprime (1,6g+320mg) /8-12h p.o. (si grossesse : déconseillé avant 10 semaines d’aménorrhée)
OU (50+10mg)/kg/j IV en 3 administrations espacées de 8h (si grossesse : déconseillé avant 10 semaines d’aménorrhée)

Vérifier la compatibilité de la recommandation avec la situation du malade

  • Tuberculose:
    • Isoniazide (5mg/kg)
      +Rifampicine (10mg/kg)
      +Pyrazinamide (30mg/kg sans dépasser 2g)
      pendant 2 mois,
    • Puis
      Isoniazide (5mg/kg)
      +Rifampicine (10mg/kg)
      pendant 10 mois